Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lire1P11260 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms