Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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