Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01852 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01852 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01852 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01852 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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