Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm42421F6X8D5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm42421F6X8D5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm42421F6X8D5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm42421F6X8D5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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