Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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