Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms