Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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