Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pramef6A2A8M8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms