Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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