Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms