Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms