Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms