Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fip1l1Q9D824 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms