Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms