Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Utp23Q9CX11 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp23Q9CX11 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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