Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms