Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
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Cldn16Q925N4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Cldn16Q925N4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
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Cldn16Q925N4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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