Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SgtbQ8VD33 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgtbQ8VD33 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms