Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms