Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Colec12Q8K4Q8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Colec12Q8K4Q8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Colec12Q8K4Q8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Colec12Q8K4Q8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms