Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf17Q8CFA7 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms