Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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