Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dsg1cQ7TSF0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms