Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd4Q6PDQ2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chd4Q6PDQ2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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