Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms