Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp19Q3UJD6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp19Q3UJD6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms