Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC166902.3-201ENSMUST00000216696 991 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms