Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms