Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc10Q3TLI0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trappc10Q3TLI0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc10Q3TLI0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms