Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms