Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ItgavP43406 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ItgavP43406 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms