Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbP41155 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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