Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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