Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ggta1P23336 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms