Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P20040 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P20040 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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