Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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PdgfaP20033 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms