Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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DmdP11531 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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DmdP11531 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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DmdP11531 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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