Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms