Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms