Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Opn1mwO35599 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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Opn1mwO35599 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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