Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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