Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms