Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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