Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gpc6Q9R087 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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