Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc1Q9QZF2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gpc1Q9QZF2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gpc1Q9QZF2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gpc1Q9QZF2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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