Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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SacsQ9JLC8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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SacsQ9JLC8 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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SacsQ9JLC8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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SacsQ9JLC8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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SacsQ9JLC8 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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SacsQ9JLC8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SacsQ9JLC8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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SacsQ9JLC8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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SacsQ9JLC8 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SacsQ9JLC8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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