Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ybx3Q9JKB3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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