Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Usp12Q9D9M2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Usp12Q9D9M2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Usp12Q9D9M2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Usp12Q9D9M2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Usp12Q9D9M2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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