Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms