Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Q9D2Q3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Q9D2Q3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Q9D2Q3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms